Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd3Q9CWR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd3Q9CWR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms