Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver1Q9CW46 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver1Q9CW46 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms