Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms