Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms