Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms