Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd1Q9CRY7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gdpd1Q9CRY7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd1Q9CRY7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms