Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms