Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ctrb1Q9CR35 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctrb1Q9CR35 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms