Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms