Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ifitm3Q9CQW9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ifitm3Q9CQW9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ifitm3Q9CQW9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ifitm3Q9CQW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ifitm3Q9CQW9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ifitm3Q9CQW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm3Q9CQW9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms