Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms