Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms