Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms