Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znhit3Q9CQK1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms