Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb5Q9CQH3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb5Q9CQH3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb5Q9CQH3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb5Q9CQH3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb5Q9CQH3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb5Q9CQH3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb5Q9CQH3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms