Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQF4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms