Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms