Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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