Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms