Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt88Q9CPR6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms