Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms