Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn6Q99PL6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms