Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms