Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms