Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms