Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp26Q99MX1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Usp26Q99MX1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp26Q99MX1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Usp26Q99MX1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms