Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramel1Q99MW3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms