Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpgs1Q99MS8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpgs1Q99MS8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms