Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrrtQ99MR6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrrtQ99MR6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms