Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbc3Q99ML1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms