Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf1Q99MK9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms