Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms