Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms