Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprtQ99M80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PtprtQ99M80 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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