Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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