Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms