Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms