Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms