Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms