Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn2Q99KJ8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn2Q99KJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms