Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Emc3Q99KI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Emc3Q99KI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms