Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms