Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms