Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms