Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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