Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Smim11aQ99J19 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Smim11aQ99J19 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Smim11aQ99J19 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Smim11aQ99J19 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim11aQ99J19 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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