Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu1Q99J10 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms