Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm9Q96EQ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm9Q96EQ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms