Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc8b1Q925Q3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms