Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms